Instructions to use GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base with libraries, inference providers, notebooks, and local apps. Follow these links to get started.

Libraries

How to use GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base with Transformers:

# Use a pipeline as a high-level helper
from transformers import pipeline

pipe = pipeline("text-generation", model="GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base", trust_remote_code=True)

# Load model directly
from transformers import AutoTokenizer, AutoModelForCausalLM

tokenizer = AutoTokenizer.from_pretrained("GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base", trust_remote_code=True)
model = AutoModelForCausalLM.from_pretrained("GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base", trust_remote_code=True, device_map="auto")

Notebooks
Google Colab
Kaggle
Local Apps Settings

vLLM

How to use GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base with vLLM:

Install from pip and serve model

# Install vLLM from pip:
pip install vllm
# Start the vLLM server:
vllm serve "GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base"
# Call the server using curl (OpenAI-compatible API):
curl -X POST "http://localhost:8000/v1/completions" \
	-H "Content-Type: application/json" \
	--data '{
		"model": "GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base",
		"prompt": "Once upon a time,",
		"max_tokens": 512,
		"temperature": 0.5
	}'

Use Docker

docker model run hf.co/GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base

SGLang

How to use GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base with SGLang:

Install from pip and serve model

# Install SGLang from pip:
pip install sglang
# Start the SGLang server:
python3 -m sglang.launch_server \
    --model-path "GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base" \
    --host 0.0.0.0 \
    --port 30000
# Call the server using curl (OpenAI-compatible API):
curl -X POST "http://localhost:30000/v1/completions" \
	-H "Content-Type: application/json" \
	--data '{
		"model": "GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base",
		"prompt": "Once upon a time,",
		"max_tokens": 512,
		"temperature": 0.5
	}'

Use Docker images

docker run --gpus all \
    --shm-size 32g \
    -p 30000:30000 \
    -v ~/.cache/huggingface:/root/.cache/huggingface \
    --env "HF_TOKEN=<secret>" \
    --ipc=host \
    lmsysorg/sglang:latest \
    python3 -m sglang.launch_server \
        --model-path "GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base" \
        --host 0.0.0.0 \
        --port 30000
# Call the server using curl (OpenAI-compatible API):
curl -X POST "http://localhost:30000/v1/completions" \
	-H "Content-Type: application/json" \
	--data '{
		"model": "GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base",
		"prompt": "Once upon a time,",
		"max_tokens": 512,
		"temperature": 0.5
	}'

Docker Model Runner
How to use GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base with Docker Model Runner:
```
docker model run hf.co/GenerTeam/GENERator-eukaryote-3b-base
```

GenerTeam commited on Jun 15

Commit

c0bb547

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special_tokens_map.json +5 -28
tokenizer.py +9 -10
tokenizer_config.json +19 -16
vocab.txt +4128 -4128

special_tokens_map.json CHANGED Viewed

@@ -1,30 +1,7 @@
 {
-  "bos_token": {
-    "content": "<s>",
-    "lstrip": false,
-    "normalized": false,
-    "rstrip": false,
-    "single_word": false
-  },
-  "eos_token": {
-    "content": "</s>",
-    "lstrip": false,
-    "normalized": false,
-    "rstrip": false,
-    "single_word": false
-  },
-  "pad_token": {
-    "content": "<pad>",
-    "lstrip": false,
-    "normalized": false,
-    "rstrip": false,
-    "single_word": false
-  },
-  "unk_token": {
-    "content": "<oov>",
-    "lstrip": false,
-    "normalized": false,
-    "rstrip": false,
-    "single_word": false
-  }
 }

 {
+  "bos_token": "<s>",
+  "eos_token": "</s>",
+  "mask_token": "<mask>",
+  "pad_token": "<pad>",
+  "unk_token": "<oov>"
 }

tokenizer.py CHANGED Viewed

@@ -55,10 +55,11 @@ class DNAKmerTokenizer(PreTrainedTokenizer):
             "|".join(re.escape(token) for token in self.special_tokens)
         )
         self.dna_pattern = re.compile(f"[A-Z]{{{self.k}}}|[A-Z]+")
         kwargs.setdefault("bos_token", "<s>")
         kwargs.setdefault("eos_token", "</s>")
-        kwargs.setdefault("unk_token", "<oov>")
         kwargs.setdefault("pad_token", "<pad>")
         super().__init__(**kwargs)
     @property
@@ -130,15 +131,17 @@ class DNAKmerTokenizer(PreTrainedTokenizer):
     def save_vocabulary(
             self, save_directory: str, filename_prefix: Optional[str] = None
     ) -> Tuple[str]:
-        import os
         vocab_file = os.path.join(
             save_directory,
             (filename_prefix + "-" if filename_prefix else "") + "vocab.txt",
         )
-        with open(vocab_file, "w", encoding="utf-8") as writer:
-            for token, token_index in sorted(self.vocab.items(), key=lambda kv: kv[1]):
-                writer.write(token + "\n")
         return (vocab_file,)
     def save_pretrained(self, save_directory: str, **kwargs):
@@ -152,7 +155,7 @@ class DNAKmerTokenizer(PreTrainedTokenizer):
         else:
             config = {}
-        # Add auto_map config
         config.update({
             "auto_map": {
                 "AutoTokenizer": [
@@ -160,10 +163,6 @@ class DNAKmerTokenizer(PreTrainedTokenizer):
                     None
                 ]
             },
-        })
-        # Add k-mer config and special token config
-        config.update({
             "k": self.k,
             "add_bos_token": self.add_bos_token,
             "add_eos_token": self.add_eos_token,

             "|".join(re.escape(token) for token in self.special_tokens)
         )
         self.dna_pattern = re.compile(f"[A-Z]{{{self.k}}}|[A-Z]+")
+        kwargs.setdefault("unk_token", "<oov>")
         kwargs.setdefault("bos_token", "<s>")
         kwargs.setdefault("eos_token", "</s>")
         kwargs.setdefault("pad_token", "<pad>")
+        kwargs.setdefault("mask_token", "<mask>")
         super().__init__(**kwargs)
     @property
     def save_vocabulary(
             self, save_directory: str, filename_prefix: Optional[str] = None
     ) -> Tuple[str]:
+        if not os.path.exists(save_directory):
+            os.makedirs(save_directory)
         vocab_file = os.path.join(
             save_directory,
             (filename_prefix + "-" if filename_prefix else "") + "vocab.txt",
         )
+        with open(vocab_file, "w", encoding="utf-8") as f:
+            for token, idx in sorted(self.vocab.items(), key=lambda x: x[1]):
+                f.write(f"{token} {idx}\n")
         return (vocab_file,)
     def save_pretrained(self, save_directory: str, **kwargs):
         else:
             config = {}
+        # Add auto_map configuration
         config.update({
             "auto_map": {
                 "AutoTokenizer": [
                     None
                 ]
             },
             "k": self.k,
             "add_bos_token": self.add_bos_token,
             "add_eos_token": self.add_eos_token,

tokenizer_config.json CHANGED Viewed

@@ -1,7 +1,4 @@
 {
-  "add_bos_token": true,
-  "add_eos_token": false,
-  "add_prefix_space": true,
   "added_tokens_decoder": {
     "0": {
       "content": "<oov>",
@@ -34,26 +31,32 @@
       "rstrip": false,
       "single_word": false,
       "special": true
     }
   },
-  "auto_map": {
-    "AutoTokenizer": [
-      "tokenizer.DNAKmerTokenizer",
-      null
-    ]
-  },
   "bos_token": "<s>",
-  "clean_up_tokenization_spaces": true,
   "eos_token": "</s>",
   "extra_special_tokens": {},
-  "legacy": true,
   "model_max_length": 1000000000000000019884624838656,
   "pad_token": "<pad>",
-  "sp_model_kwargs": {},
-  "spaces_between_special_tokens": false,
   "tokenizer_class": "DNAKmerTokenizer",
   "unk_token": "<oov>",
-  "use_default_system_prompt": false,
-  "use_fast": false,
-  "k": 6
 }

 {
   "added_tokens_decoder": {
     "0": {
       "content": "<oov>",
       "rstrip": false,
       "single_word": false,
       "special": true
+    },
+    "4": {
+      "content": "<mask>",
+      "lstrip": false,
+      "normalized": false,
+      "rstrip": false,
+      "single_word": false,
+      "special": true
     }
   },
   "bos_token": "<s>",
+  "clean_up_tokenization_spaces": false,
   "eos_token": "</s>",
   "extra_special_tokens": {},
+  "mask_token": "<mask>",
   "model_max_length": 1000000000000000019884624838656,
   "pad_token": "<pad>",
   "tokenizer_class": "DNAKmerTokenizer",
   "unk_token": "<oov>",
+  "auto_map": {
+    "AutoTokenizer": [
+      "tokenizer.DNAKmerTokenizer",
+      null
+    ]
+  },
+  "k": 6,
+  "add_bos_token": true,
+  "add_eos_token": false
 }

vocab.txt CHANGED Viewed

@@ -1,4128 +1,4128 @@
-<oov>
-<s>
-</s>
-<pad>
-<mask>
-<bog>
-<eog>
-<bok>
-<eok>
-<+>
-<->
-<cds>
-<pseudo>
-<tRNA>
-<rRNA>
-<ncRNA>
-<miscRNA>
-<mam>
-<vrt>
-<inv>
-<pln>
-<fng>
-<prt>
-<arc>
-<bct>
-<mit>
-<plt>
-<plm>
-<vir>
-<sp0>
-<sp1>
-<sp2>
-AAAAAA
-AAAAAT
-AAAAAC
-AAAAAG
-AAAATA
-AAAATT
-AAAATC
-AAAATG
-AAAACA
-AAAACT
-AAAACC
-AAAACG
-AAAAGA
-AAAAGT
-AAAAGC
-AAAAGG
-AAATAA
-AAATAT
-AAATAC
-AAATAG
-AAATTA
-AAATTT
-AAATTC
-AAATTG
-AAATCA
-AAATCT
-AAATCC
-AAATCG
-AAATGA
-AAATGT
-AAATGC
-AAATGG
-AAACAA
-AAACAT
-AAACAC
-AAACAG
-AAACTA
-AAACTT
-AAACTC
-AAACTG
-AAACCA
-AAACCT
-AAACCC
-AAACCG
-AAACGA
-AAACGT
-AAACGC
-AAACGG
-AAAGAA
-AAAGAT
-AAAGAC
-AAAGAG
-AAAGTA
-AAAGTT
-AAAGTC
-AAAGTG
-AAAGCA
-AAAGCT
-AAAGCC
-AAAGCG
-AAAGGA
-AAAGGT
-AAAGGC
-AAAGGG
-AATAAA
-AATAAT
-AATAAC
-AATAAG
-AATATA
-AATATT
-AATATC
-AATATG
-AATACA
-AATACT
-AATACC
-AATACG
-AATAGA
-AATAGT
-AATAGC
-AATAGG
-AATTAA
-AATTAT
-AATTAC
-AATTAG
-AATTTA
-AATTTT
-AATTTC
-AATTTG
-AATTCA
-AATTCT
-AATTCC
-AATTCG
-AATTGA
-AATTGT
-AATTGC
-AATTGG
-AATCAA
-AATCAT
-AATCAC
-AATCAG
-AATCTA
-AATCTT
-AATCTC
-AATCTG
-AATCCA
-AATCCT
-AATCCC
-AATCCG
-AATCGA
-AATCGT
-AATCGC
-AATCGG
-AATGAA
-AATGAT
-AATGAC
-AATGAG
-AATGTA
-AATGTT
-AATGTC
-AATGTG
-AATGCA
-AATGCT
-AATGCC
-AATGCG
-AATGGA
-AATGGT
-AATGGC
-AATGGG
-AACAAA
-AACAAT
-AACAAC
-AACAAG
-AACATA
-AACATT
-AACATC
-AACATG
-AACACA
-AACACT
-AACACC
-AACACG
-AACAGA
-AACAGT
-AACAGC
-AACAGG
-AACTAA
-AACTAT
-AACTAC
-AACTAG
-AACTTA
-AACTTT
-AACTTC
-AACTTG
-AACTCA
-AACTCT
-AACTCC
-AACTCG
-AACTGA
-AACTGT
-AACTGC
-AACTGG
-AACCAA
-AACCAT
-AACCAC
-AACCAG
-AACCTA
-AACCTT
-AACCTC
-AACCTG
-AACCCA
-AACCCT
-AACCCC
-AACCCG
-AACCGA
-AACCGT
-AACCGC
-AACCGG
-AACGAA
-AACGAT
-AACGAC
-AACGAG
-AACGTA
-AACGTT
-AACGTC
-AACGTG
-AACGCA
-AACGCT
-AACGCC
-AACGCG
-AACGGA
-AACGGT
-AACGGC
-AACGGG
-AAGAAA
-AAGAAT
-AAGAAC
-AAGAAG
-AAGATA
-AAGATT
-AAGATC
-AAGATG
-AAGACA
-AAGACT
-AAGACC
-AAGACG
-AAGAGA
-AAGAGT
-AAGAGC
-AAGAGG
-AAGTAA
-AAGTAT
-AAGTAC
-AAGTAG
-AAGTTA
-AAGTTT
-AAGTTC
-AAGTTG
-AAGTCA
-AAGTCT
-AAGTCC
-AAGTCG
-AAGTGA
-AAGTGT
-AAGTGC
-AAGTGG
-AAGCAA
-AAGCAT
-AAGCAC
-AAGCAG
-AAGCTA
-AAGCTT
-AAGCTC
-AAGCTG
-AAGCCA
-AAGCCT
-AAGCCC
-AAGCCG
-AAGCGA
-AAGCGT
-AAGCGC
-AAGCGG
-AAGGAA
-AAGGAT
-AAGGAC
-AAGGAG
-AAGGTA
-AAGGTT
-AAGGTC
-AAGGTG
-AAGGCA
-AAGGCT
-AAGGCC
-AAGGCG
-AAGGGA
-AAGGGT
-AAGGGC
-AAGGGG
-ATAAAA
-ATAAAT
-ATAAAC
-ATAAAG
-ATAATA
-ATAATT
-ATAATC
-ATAATG
-ATAACA
-ATAACT
-ATAACC
-ATAACG
-ATAAGA
-ATAAGT
-ATAAGC
-ATAAGG
-ATATAA
-ATATAT
-ATATAC
-ATATAG
-ATATTA
-ATATTT
-ATATTC
-ATATTG
-ATATCA
-ATATCT
-ATATCC
-ATATCG
-ATATGA
-ATATGT
-ATATGC
-ATATGG
-ATACAA
-ATACAT
-ATACAC
-ATACAG
-ATACTA
-ATACTT
-ATACTC
-ATACTG
-ATACCA
-ATACCT
-ATACCC
-ATACCG
-ATACGA
-ATACGT
-ATACGC
-ATACGG
-ATAGAA
-ATAGAT
-ATAGAC
-ATAGAG
-ATAGTA
-ATAGTT
-ATAGTC
-ATAGTG
-ATAGCA
-ATAGCT
-ATAGCC
-ATAGCG
-ATAGGA
-ATAGGT
-ATAGGC
-ATAGGG
-ATTAAA
-ATTAAT
-ATTAAC
-ATTAAG
-ATTATA
-ATTATT
-ATTATC
-ATTATG
-ATTACA
-ATTACT
-ATTACC
-ATTACG
-ATTAGA
-ATTAGT
-ATTAGC
-ATTAGG
-ATTTAA
-ATTTAT
-ATTTAC
-ATTTAG
-ATTTTA
-ATTTTT
-ATTTTC
-ATTTTG
-ATTTCA
-ATTTCT
-ATTTCC
-ATTTCG
-ATTTGA
-ATTTGT
-ATTTGC
-ATTTGG
-ATTCAA
-ATTCAT
-ATTCAC
-ATTCAG
-ATTCTA
-ATTCTT
-ATTCTC
-ATTCTG
-ATTCCA
-ATTCCT
-ATTCCC
-ATTCCG
-ATTCGA
-ATTCGT
-ATTCGC
-ATTCGG
-ATTGAA
-ATTGAT
-ATTGAC
-ATTGAG
-ATTGTA
-ATTGTT
-ATTGTC
-ATTGTG
-ATTGCA
-ATTGCT
-ATTGCC
-ATTGCG
-ATTGGA
-ATTGGT
-ATTGGC
-ATTGGG
-ATCAAA
-ATCAAT
-ATCAAC
-ATCAAG
-ATCATA
-ATCATT
-ATCATC
-ATCATG
-ATCACA
-ATCACT
-ATCACC
-ATCACG
-ATCAGA
-ATCAGT
-ATCAGC
-ATCAGG
-ATCTAA
-ATCTAT
-ATCTAC
-ATCTAG
-ATCTTA
-ATCTTT
-ATCTTC
-ATCTTG
-ATCTCA
-ATCTCT
-ATCTCC
-ATCTCG
-ATCTGA
-ATCTGT
-ATCTGC
-ATCTGG
-ATCCAA
-ATCCAT
-ATCCAC
-ATCCAG
-ATCCTA
-ATCCTT
-ATCCTC
-ATCCTG
-ATCCCA
-ATCCCT
-ATCCCC
-ATCCCG
-ATCCGA
-ATCCGT
-ATCCGC
-ATCCGG
-ATCGAA
-ATCGAT
-ATCGAC
-ATCGAG
-ATCGTA
-ATCGTT
-ATCGTC
-ATCGTG
-ATCGCA
-ATCGCT
-ATCGCC
-ATCGCG
-ATCGGA
-ATCGGT
-ATCGGC
-ATCGGG
-ATGAAA
-ATGAAT
-ATGAAC
-ATGAAG
-ATGATA
-ATGATT
-ATGATC
-ATGATG
-ATGACA
-ATGACT
-ATGACC
-ATGACG
-ATGAGA
-ATGAGT
-ATGAGC
-ATGAGG
-ATGTAA
-ATGTAT
-ATGTAC
-ATGTAG
-ATGTTA
-ATGTTT
-ATGTTC
-ATGTTG
-ATGTCA
-ATGTCT
-ATGTCC
-ATGTCG
-ATGTGA
-ATGTGT
-ATGTGC
-ATGTGG
-ATGCAA
-ATGCAT
-ATGCAC
-ATGCAG
-ATGCTA
-ATGCTT
-ATGCTC
-ATGCTG
-ATGCCA
-ATGCCT
-ATGCCC
-ATGCCG
-ATGCGA
-ATGCGT
-ATGCGC
-ATGCGG
-ATGGAA
-ATGGAT
-ATGGAC
-ATGGAG
-ATGGTA
-ATGGTT
-ATGGTC
-ATGGTG
-ATGGCA
-ATGGCT
-ATGGCC
-ATGGCG
-ATGGGA
-ATGGGT
-ATGGGC
-ATGGGG
-ACAAAA
-ACAAAT
-ACAAAC
-ACAAAG
-ACAATA
-ACAATT
-ACAATC
-ACAATG
-ACAACA
-ACAACT
-ACAACC
-ACAACG
-ACAAGA
-ACAAGT
-ACAAGC
-ACAAGG
-ACATAA
-ACATAT
-ACATAC
-ACATAG
-ACATTA
-ACATTT
-ACATTC
-ACATTG
-ACATCA
-ACATCT
-ACATCC
-ACATCG
-ACATGA
-ACATGT
-ACATGC
-ACATGG
-ACACAA
-ACACAT
-ACACAC
-ACACAG
-ACACTA
-ACACTT
-ACACTC
-ACACTG
-ACACCA
-ACACCT
-ACACCC
-ACACCG
-ACACGA
-ACACGT
-ACACGC
-ACACGG
-ACAGAA
-ACAGAT
-ACAGAC
-ACAGAG
-ACAGTA
-ACAGTT
-ACAGTC
-ACAGTG
-ACAGCA
-ACAGCT
-ACAGCC
-ACAGCG
-ACAGGA
-ACAGGT
-ACAGGC
-ACAGGG
-ACTAAA
-ACTAAT
-ACTAAC
-ACTAAG
-ACTATA
-ACTATT
-ACTATC
-ACTATG
-ACTACA
-ACTACT
-ACTACC
-ACTACG
-ACTAGA
-ACTAGT
-ACTAGC
-ACTAGG
-ACTTAA
-ACTTAT
-ACTTAC
-ACTTAG
-ACTTTA
-ACTTTT
-ACTTTC
-ACTTTG
-ACTTCA
-ACTTCT
-ACTTCC
-ACTTCG
-ACTTGA
-ACTTGT
-ACTTGC
-ACTTGG
-ACTCAA
-ACTCAT
-ACTCAC
-ACTCAG
-ACTCTA
-ACTCTT
-ACTCTC
-ACTCTG
-ACTCCA
-ACTCCT
-ACTCCC
-ACTCCG
-ACTCGA
-ACTCGT
-ACTCGC
-ACTCGG
-ACTGAA
-ACTGAT
-ACTGAC
-ACTGAG
-ACTGTA
-ACTGTT
-ACTGTC
-ACTGTG
-ACTGCA
-ACTGCT
-ACTGCC
-ACTGCG
-ACTGGA
-ACTGGT
-ACTGGC
-ACTGGG
-ACCAAA
-ACCAAT
-ACCAAC
-ACCAAG
-ACCATA
-ACCATT
-ACCATC
-ACCATG
-ACCACA
-ACCACT
-ACCACC
-ACCACG
-ACCAGA
-ACCAGT
-ACCAGC
-ACCAGG
-ACCTAA
-ACCTAT
-ACCTAC
-ACCTAG
-ACCTTA
-ACCTTT
-ACCTTC
-ACCTTG
-ACCTCA
-ACCTCT
-ACCTCC
-ACCTCG
-ACCTGA
-ACCTGT
-ACCTGC
-ACCTGG
-ACCCAA
-ACCCAT
-ACCCAC
-ACCCAG
-ACCCTA
-ACCCTT
-ACCCTC
-ACCCTG
-ACCCCA
-ACCCCT
-ACCCCC
-ACCCCG
-ACCCGA
-ACCCGT
-ACCCGC
-ACCCGG
-ACCGAA
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+CAACAG 2115
+CAACTA 2116
+CAACTT 2117
+CAACTC 2118
+CAACTG 2119
+CAACCA 2120
+CAACCT 2121
+CAACCC 2122
+CAACCG 2123
+CAACGA 2124
+CAACGT 2125
+CAACGC 2126
+CAACGG 2127
+CAAGAA 2128
+CAAGAT 2129
+CAAGAC 2130
+CAAGAG 2131
+CAAGTA 2132
+CAAGTT 2133
+CAAGTC 2134
+CAAGTG 2135
+CAAGCA 2136
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+CAAGGA 2140
+CAAGGT 2141
+CAAGGC 2142
+CAAGGG 2143
+CATAAA 2144
+CATAAT 2145
+CATAAC 2146
+CATAAG 2147
+CATATA 2148
+CATATT 2149
+CATATC 2150
+CATATG 2151
+CATACA 2152
+CATACT 2153
+CATACC 2154
+CATACG 2155
+CATAGA 2156
+CATAGT 2157
+CATAGC 2158
+CATAGG 2159
+CATTAA 2160
+CATTAT 2161
+CATTAC 2162
+CATTAG 2163
+CATTTA 2164
+CATTTT 2165
+CATTTC 2166
+CATTTG 2167
+CATTCA 2168
+CATTCT 2169
+CATTCC 2170
+CATTCG 2171
+CATTGA 2172
+CATTGT 2173
+CATTGC 2174
+CATTGG 2175
+CATCAA 2176
+CATCAT 2177
+CATCAC 2178
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+CATCTA 2180
+CATCTT 2181
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+CATCTG 2183
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+CATCGG 2191
+CATGAA 2192
+CATGAT 2193
+CATGAC 2194
+CATGAG 2195
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+CATGTT 2197
+CATGTC 2198
+CATGTG 2199
+CATGCA 2200
+CATGCT 2201
+CATGCC 2202
+CATGCG 2203
+CATGGA 2204
+CATGGT 2205
+CATGGC 2206
+CATGGG 2207
+CACAAA 2208
+CACAAT 2209
+CACAAC 2210
+CACAAG 2211
+CACATA 2212
+CACATT 2213
+CACATC 2214
+CACATG 2215
+CACACA 2216
+CACACT 2217
+CACACC 2218
+CACACG 2219
+CACAGA 2220
+CACAGT 2221
+CACAGC 2222
+CACAGG 2223
+CACTAA 2224
+CACTAT 2225
+CACTAC 2226
+CACTAG 2227
+CACTTA 2228
+CACTTT 2229
+CACTTC 2230
+CACTTG 2231
+CACTCA 2232
+CACTCT 2233
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+CACTGC 2238
+CACTGG 2239
+CACCAA 2240
+CACCAT 2241
+CACCAC 2242
+CACCAG 2243
+CACCTA 2244
+CACCTT 2245
+CACCTC 2246
+CACCTG 2247
+CACCCA 2248
+CACCCT 2249
+CACCCC 2250
+CACCCG 2251
+CACCGA 2252
+CACCGT 2253
+CACCGC 2254
+CACCGG 2255
+CACGAA 2256
+CACGAT 2257
+CACGAC 2258
+CACGAG 2259
+CACGTA 2260
+CACGTT 2261
+CACGTC 2262
+CACGTG 2263
+CACGCA 2264
+CACGCT 2265
+CACGCC 2266
+CACGCG 2267
+CACGGA 2268
+CACGGT 2269
+CACGGC 2270
+CACGGG 2271
+CAGAAA 2272
+CAGAAT 2273
+CAGAAC 2274
+CAGAAG 2275
+CAGATA 2276
+CAGATT 2277
+CAGATC 2278
+CAGATG 2279
+CAGACA 2280
+CAGACT 2281
+CAGACC 2282
+CAGACG 2283
+CAGAGA 2284
+CAGAGT 2285
+CAGAGC 2286
+CAGAGG 2287
+CAGTAA 2288
+CAGTAT 2289
+CAGTAC 2290
+CAGTAG 2291
+CAGTTA 2292
+CAGTTT 2293
+CAGTTC 2294
+CAGTTG 2295
+CAGTCA 2296
+CAGTCT 2297
+CAGTCC 2298
+CAGTCG 2299
+CAGTGA 2300
+CAGTGT 2301
+CAGTGC 2302
+CAGTGG 2303
+CAGCAA 2304
+CAGCAT 2305
+CAGCAC 2306
+CAGCAG 2307
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+CAGCTT 2309
+CAGCTC 2310
+CAGCTG 2311
+CAGCCA 2312
+CAGCCT 2313
+CAGCCC 2314
+CAGCCG 2315
+CAGCGA 2316
+CAGCGT 2317
+CAGCGC 2318
+CAGCGG 2319
+CAGGAA 2320
+CAGGAT 2321
+CAGGAC 2322
+CAGGAG 2323
+CAGGTA 2324
+CAGGTT 2325
+CAGGTC 2326
+CAGGTG 2327
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+CAGGCT 2329
+CAGGCC 2330
+CAGGCG 2331
+CAGGGA 2332
+CAGGGT 2333
+CAGGGC 2334
+CAGGGG 2335
+CTAAAA 2336
+CTAAAT 2337
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+CTAATA 2340
+CTAATT 2341
+CTAATC 2342
+CTAATG 2343
+CTAACA 2344
+CTAACT 2345
+CTAACC 2346
+CTAACG 2347
+CTAAGA 2348
+CTAAGT 2349
+CTAAGC 2350
+CTAAGG 2351
+CTATAA 2352
+CTATAT 2353
+CTATAC 2354
+CTATAG 2355
+CTATTA 2356
+CTATTT 2357
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+CTATCA 2360
+CTATCT 2361
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+CTATCG 2363
+CTATGA 2364
+CTATGT 2365
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+CTACTA 2372
+CTACTT 2373
+CTACTC 2374
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+CTACCA 2376
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+CTTATA 2404
+CTTATT 2405
+CTTATC 2406
+CTTATG 2407
+CTTACA 2408
+CTTACT 2409
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+CTCATA 2468
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+CTCACA 2472
+CTCACT 2473
+CTCACC 2474
+CTCACG 2475
+CTCAGA 2476
+CTCAGT 2477
+CTCAGC 2478
+CTCAGG 2479
+CTCTAA 2480
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+CTCCTA 2500
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+CTCCTC 2502
+CTCCTG 2503
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+CTCGGT 2525
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+CTGAAA 2528
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+CTGATA 2532
+CTGATT 2533
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+CTGACC 2538
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+CTGAGA 2540
+CTGAGT 2541
+CTGAGC 2542
+CTGAGG 2543
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+CTGCAA 2560
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+CTGCTA 2564
+CTGCTT 2565
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+CTGCTG 2567
+CTGCCA 2568
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+CTGCCC 2570
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+CTGCGA 2572
+CTGCGT 2573
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+CTGCGG 2575
+CTGGAA 2576
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+CTGGAG 2579
+CTGGTA 2580
+CTGGTT 2581
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+CTGGCA 2584
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+CTGGGA 2588
+CTGGGT 2589
+CTGGGC 2590
+CTGGGG 2591
+CCAAAA 2592
+CCAAAT 2593
+CCAAAC 2594
+CCAAAG 2595
+CCAATA 2596
+CCAATT 2597
+CCAATC 2598
+CCAATG 2599
+CCAACA 2600
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+CCATAA 2608
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+CCATAC 2610
+CCATAG 2611
+CCATTA 2612
+CCATTT 2613
+CCATTC 2614
+CCATTG 2615
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+CCATCT 2617
+CCATCC 2618
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+CCATGA 2620
+CCATGT 2621
+CCATGC 2622
+CCATGG 2623
+CCACAA 2624
+CCACAT 2625
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+CCACAG 2627
+CCACTA 2628
+CCACTT 2629
+CCACTC 2630
+CCACTG 2631
+CCACCA 2632
+CCACCT 2633
+CCACCC 2634
+CCACCG 2635
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+CCACGT 2637
+CCACGC 2638
+CCACGG 2639
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+CCAGAC 2642
+CCAGAG 2643
+CCAGTA 2644
+CCAGTT 2645
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+CCAGGA 2652
+CCAGGT 2653
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+CCAGGG 2655
+CCTAAA 2656
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+CCTATA 2660
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+CCTATC 2662
+CCTATG 2663
+CCTACA 2664
+CCTACT 2665
+CCTACC 2666
+CCTACG 2667
+CCTAGA 2668
+CCTAGT 2669
+CCTAGC 2670
+CCTAGG 2671
+CCTTAA 2672
+CCTTAT 2673
+CCTTAC 2674
+CCTTAG 2675
+CCTTTA 2676
+CCTTTT 2677
+CCTTTC 2678
+CCTTTG 2679
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+CCTCAA 2688
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+CCTCTG 2695
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+CCCATA 2724
+CCCATT 2725
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+CCCACA 2728
+CCCACT 2729
+CCCACC 2730
+CCCACG 2731
+CCCAGA 2732
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+CCCAGC 2734
+CCCAGG 2735
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+CCCGCA 2776
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+CCCGGT 2781
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+CCGATA 2788
+CCGATT 2789
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+CCGATG 2791
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+CCGACT 2793
+CCGACC 2794
+CCGACG 2795
+CCGAGA 2796
+CCGAGT 2797
+CCGAGC 2798
+CCGAGG 2799
+CCGTAA 2800
+CCGTAT 2801
+CCGTAC 2802
+CCGTAG 2803
+CCGTTA 2804
+CCGTTT 2805
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+CCGTCA 2808
+CCGTCT 2809
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+CCGTGA 2812
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+CCGTGG 2815
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+CCGCTA 2820
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+CCGCTG 2823
+CCGCCA 2824
+CCGCCT 2825
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